在中成药中，有很多上清丸，如“上清丸”“阮氏上清丸”“黄连上清丸”“牛黄上清丸”“芎菊上清丸”“明目上清丸”等，它们虽都是上清丸，但在功效上有所异同。

为经验方，选自《药典》，由大黄、黄芩、黄柏、连翘、栀子、白芷、防风、荆芥、桔梗、薄荷、川芎、菊花等12味中药组成，具有疏风清热、解毒、通便的功效，主要用于风、热引起的上焦病变，诸如头晕耳鸣、目赤、口舌生疮、牙龈肿痛、大便秘结等。用法：每次6克，每日1～2次，温开水送服。

为老字号经验方，主要成分是儿茶、马槟榔、薄荷叶、乌梅、硼砂、诃子、山豆根、冰片、甘草等，具有清热降火、生津止渴的功效，用于治疗咽喉肿痛、牙疳口疮、津液不足、口干舌燥等。临床上用于治疗口腔溃疡也有较好的疗效。用法：吞服或含服，一次0.5克，一日2～4次。

处方由明代龚廷贤《万病回春》中的洗肝明目散加减化裁而成。处方在上清丸的基础上加了黄连、石膏、蔓荆子、荆芥穗、旋覆花、甘草等6味药，可用于上焦风热、头昏脑胀、牙龈肿痛、口舌生疮、咽喉红肿、耳痛耳鸣、暴发火眼、大便干燥、小便黄赤等。此方比上清丸增加了散风、清热药物，散风、清热并重，清上中焦风热的作用比上清丸强；散风作用强于牛黄上清丸。用法：每次1丸（9克），每日1～2次，温开水送服。

处方来源于明代李梃《医学入门》中的原方加减而成。比黄连上清丸的处方中加了牛黄、冰片等清热解毒作用较强的药物，同时还增加了赤芍、当归、地黄等清血热、活血药物，故偏重于清热解毒，治疗火毒炽盛引起的头痛眩晕、目赤耳鸣、咽喉肿痛、口舌生疮、牙龈肿痛、大便燥结、疮肿等。其散风作用逊于黄连上清丸。用法：每次1丸，每日2次，温开水送服。

处方来源于《局方》中的川芎茶调散加减化裁而成。方由川芎、菊花、黄芩、栀子、蔓荆子（炒）、黄连、薄荷、连翘、荆芥穗、羌活、藁本、桔梗、防风、甘草、白芷等中药组成。川芎、菊花专清头风，为主药，辅以防风、荆芥、薄荷加强祛风功效，黄柏、黄芩、大黄、栀子清上焦积热，引热下行从二便而去，滑石助栀子清利湿热，以三焦气化，使以桔梗清宣肺热，引药上行头目，以奏祛风清热之效，甘草调和诸药，适用于上焦风热所致的头目诸疾，对各种头痛，如偏头痛、三叉神经痛、丛集性头痛、癫痫头痛等有较好的祛风止痛作用。用法：口服，每次6克，每日2次，温开水送服。

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